20 Jahre nach dem ersten Tiberiumkrieg steht der GDI und NOD eine Gefahr gegenüber, die vielleicht noch größter ist, als die Bruderschaft von NOD es jemals war - das Tiberium. Große Teile der Erdoberfläche sind inzwischen durch das seltsame Mineral unbewohnbar geworden und man hat begonnen, Zivilisten in die noch nicht befallenen Gebiete wie die Antarktis zu evakuieren. Seit der Zerstörung des Tempels von NOD hat auch niemand mehr etwas von Kane gehört. Doch nun taucht er nach 20 Jahren wieder auf um erneut seine Hand nach der Weltherrschaft auszustrecken - der Angriff auf die GDI beginnt und mit ihm der zweite Tiberium Krieg...

Im ersten Teil von Alarmstufe Rot reiste Albert Einstein in die Vergangenheit, um Hitlers Herrschaft zu verhindern, noch bevor sie wirklich begann, und so die Geschichte umzuschreiben, wodurch sich für die Sowjets die Möglichkeit zum Aufstieg eröffneten. Alarmstufe Rot 2 setzt etwa zwanzig Jahre nach diesen Ereignissen ein. Die Sowjets sind in ihre alten Verhaltensweisen zurückgefallen. Mit Hilfe neuer Technologien wie mentaler Kontrolle von Menschen sind sie erfolgreich in die Vereinigten Staaten von Amerika eingefallen.

Von den sonnigen Florida Keys bis ins gefrorene Moskau führten die Alliierten und die Sowjets Krieg. Während diesem Krieg plante Yuri im geheimen seine intriganten Pläne die Weltherrschaft zu erlangen. Premier Romanov unterzeichnete einen historischen Friedensvertrag mit den Allierten und die Welt war frei. Doch nun ist Yuris Zeit gekommen die Geschichte erneut zu verändern um Rache an seinen Feinden zu nehmen.

In Command & Conquer™ Generäle eröffnet sich eine völlig neue Storyline um einen möglichen Konflikt 20 Jahre in unserer Zukunft. Die Kontrahenten sind die Westliche Allianz, der Asiatische Pakt und die Internationale Befreiungsgruppe. Der Spieler übernimmt das Kommando über die Cyborg-Truppen in der Rolle eines der höchsten Generäle.

Die Stunde Null ist da, und es ist Zeit, die modernste Waffentechnik im Kampf um den Titel des mächtigsten Generals der Welt einzusetzen. In Command & Conquer™ Generäle: Die Stunde Null, dem ersten Erweiterungspack zu Command & Conquer Generäle™, führen die Spieler einen globalen Kampf um die Herrschaft über die moderne Welt und stellen sich der ultimativen Herausforderung, indem sie gegen die besten Kommandobots antreten. Ausgewählt werden kann aus einer Vielzahl neuer Einheiten und einem Arsenal neuer Hochtechnologie-Waffen, und die Spieler können alles einsetzen, um einen gegnerischen General auszuschalten.